注销公司是一个复杂且耗时的过程，需要遵守一系列法定程序。以下是南京注销公司的一般流程及相关费用：

注销流程：

1. 召开股东会或董事会：

决议解散公司。形成《公司解散决议书》，并由全体股东或董事签署。

2. 成立清算组：

清算组一般由股东或董事组成，负责处理公司的财产、债务等事项。

3. 清算备案/公告：

向工商局提交清算公告，申请清算备案。

在报纸上刊登清算公告（一般需要45天公告期）。

4. 结清税务：

到税务局申请注销税务登记。需要提供税务登记证、财务报表、最近三年的税务申报表等材料。

完成税务清算后，税务局会出具税务清算证明。

5. 注销工商登记：

向工商局提交注销申请，提供公司清算报告、税务清算证明等文件。

工商局审核后，出具准予注销登记通知书。

6. 注销其他证照：

注销公司印章、银行账户、社保账户及其他相关证照。

所需费用：

1. 税务清算费用：

视公司具体情况而定。可能需要补缴税款、滞纳金及罚款等。

2. 公告费用：

在报纸上刊登清算公告的费用约为500-1500元。

3. 代理费用：

如果聘请第三方代理机构处理注销事宜，代理费用大致在3000-10000元左右，视公司的复杂程度和代理机构的收费标准而定。

4. 其他费用：

注销过程中可能会涉及其他费用，如银行账户注销手续费、清算组成员的工作报酬等。

请注意，注销公司的整个流程大约需要3-6个月，甚至更长时间，视具体情况而定。建议在开始注销手续之前，详细咨询专业人士或工商部门以获取最新的政策和具体的操作指南。